
鑒定抗體的特異性四種基本方法介紹
抗體(antibody,Ab)是機(jī)體在體內(nèi)存在的外來分子、微生物等抗原物質(zhì)刺激下,由B淋 巴細(xì)胞或記憶細(xì)胞增殖分化成的漿細(xì)胞所產(chǎn)生的、可與相應(yīng)抗原發(fā)生特異性結(jié)合的免 疫球蛋白(immunoglobulins,Ig),主要分布在血清中,也分布于組織液及外分泌液中??贵w特異性鑒定是免 疫化學(xué)技術(shù)中,確??乖?抗體反應(yīng)專一性的基礎(chǔ)。從根本上驗(yàn)證特異性,投稿國(guó)際期刊,常常需要準(zhǔn)備這方面數(shù)據(jù)。
鑒定抗體的特異性有四種基本方法:分子遺傳法、獨(dú)立抗體驗(yàn)證法、正交法和標(biāo)簽蛋白法。四種方法并非必須同時(shí)采用。通常,根據(jù)實(shí)驗(yàn)的目的和研究設(shè)計(jì)的特點(diǎn),選擇對(duì)自己的實(shí)驗(yàn)來說具有說服力的1到2種即可。
1、分子遺傳法。
對(duì)于遺傳編碼清楚的蛋白質(zhì),可采用分子遺傳學(xué)技術(shù)(基因敲除模型、CRISPR-Cas9、RNA干擾等)將該蛋白的表達(dá)水平顯著降低,然后用待檢抗體進(jìn)行標(biāo)記。如果得到陽性減弱或消失的結(jié)果,說明抗體標(biāo)記的正是該蛋白質(zhì)。采用該方法要注意兩個(gè)問題。其一,針對(duì)基因的敲除或敲減操作不一定能馬上減少相應(yīng)的蛋白質(zhì)水平。有的蛋白質(zhì)在生物樣本中可能有足量?jī)?chǔ)備,存在“緩沖池";必須耗去這部分存量才能觀察到表達(dá)的下降。能否在允許的時(shí)間內(nèi)下調(diào)蛋白水平,是一個(gè)需要預(yù)試的問題。其二,基因及相應(yīng)的蛋白質(zhì)水平下調(diào)后,抗體標(biāo)記強(qiáng)度減弱,其實(shí)驗(yàn)證了抗體和該基因產(chǎn)物的“相關(guān)性",但嚴(yán)格說來,還有可能標(biāo)記的并不是目標(biāo)蛋白質(zhì)。尚存在這樣的可能:抗體標(biāo)記的蛋白質(zhì)是與目標(biāo)蛋白有密切相互作用的另一種蛋白。比如,目標(biāo)蛋白減少后,抗體實(shí)際標(biāo)記的蛋白無從錨定(比如膜蛋白),進(jìn)而在標(biāo)本處理過程中流失,結(jié)果免 疫標(biāo)記強(qiáng)度減弱。此時(shí)應(yīng)設(shè)計(jì)針對(duì)性的實(shí)驗(yàn)來補(bǔ)充驗(yàn)證。
2、獨(dú)立抗體驗(yàn)證法。
同一目標(biāo)分子,可采用針對(duì)不同抗原決定簇的抗體來標(biāo)記。當(dāng)需要對(duì)某種蛋白分子進(jìn)行免 疫標(biāo)記時(shí),如果手中已有經(jīng)過特異性鑒定合格的其他抗體,且識(shí)別的結(jié)構(gòu)位點(diǎn)與待檢抗體不同,那么原有抗體就可作為一個(gè)良好的陽性參照。如果待檢抗體與原有的合格抗體具有相同的標(biāo)記結(jié)果,說明待檢抗體的特異性是合格的。本法應(yīng)用時(shí)須注意蛋白分子亞型之間的區(qū)別。比如,待檢抗體與原有合格抗體的識(shí)別位點(diǎn)在有的亞型二者都存在,而有的亞型則可能缺少其中之一。結(jié)構(gòu)變化可能引起功能和分布的差別,此時(shí)本法就不能起到鑒定作用。
3、正交法。
正交法即采用互不影響的技術(shù)對(duì)抗體標(biāo)記的是否為目標(biāo)分子進(jìn)行鑒定的方法。比如要鑒定抗體是否能特異性標(biāo)記某蛋白質(zhì),可通過質(zhì)譜技術(shù)、色譜分離技術(shù)、針對(duì)**該蛋白的RNA的原位雜交等,與抗體標(biāo)記一道進(jìn)行平行實(shí)驗(yàn)。如果不同技術(shù)的檢測(cè)豐度/強(qiáng)度一致,說明抗體的標(biāo)記具有特異性。采用該法時(shí)須注意各種技術(shù)自身的非特異性問題,避免因參照技術(shù)本身的特異性缺陷而減弱鑒定結(jié)果的說服力。
4、標(biāo)簽蛋白法。
可采用FLAG、V5等親和標(biāo)簽或GFP等熒光偶聯(lián)蛋白對(duì)待檢抗體進(jìn)行鑒定。如果抗親和標(biāo)簽的抗體標(biāo)記強(qiáng)度或熒光信號(hào)強(qiáng)度與待檢抗體的標(biāo)記強(qiáng)度一致,則說明待檢抗體具有特異性。